19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_01019 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_01019  SCF ubiquitin ligase complex subunit CulA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12960)  100 
 
 
764 aa  1587    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01140  ubiquitin-protein ligase, putative  47.66 
 
 
775 aa  699    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29770  ubiquitin ligase (cullin) of SCF involved in cell cycle control  37.11 
 
 
776 aa  518  1.0000000000000001e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50090  predicted protein  30.17 
 
 
745 aa  325  3e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22367  CULlin protein 3  30.56 
 
 
762 aa  311  2.9999999999999997e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264277  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45419  predicted protein  32.32 
 
 
702 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29317  CULlin protein 1  29.6 
 
 
741 aa  306  6e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291642  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33783  predicted protein  28.59 
 
 
786 aa  280  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.365007 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10008  ubiquitin ligase subunit CulD, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12680)  30.66 
 
 
880 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122406  normal  0.163465 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03939  SCF ubiquitin ligase subunit CulC, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08220)  27.45 
 
 
823 aa  259  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00875329  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04610  ubiquitin-protein ligase, putative  26.3 
 
 
808 aa  182  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51711  predicted protein  24.46 
 
 
736 aa  179  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00408227  normal  0.0250071 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04260  ubiquitin-protein ligase, putative  31.98 
 
 
811 aa  174  5e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229428  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44571  CULlin protein 4  28.31 
 
 
821 aa  160  9e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.457132  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80515  cullin, ubiquitin ligase activity  25.25 
 
 
783 aa  118  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.205176 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01120  expressed protein  25.36 
 
 
241 aa  77  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87387  predicted protein  28.45 
 
 
830 aa  53.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.929125 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36569  predicted protein  29.29 
 
 
166 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47273  predicted protein  22.17 
 
 
767 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.662856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>