18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_10008 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_10008  ubiquitin ligase subunit CulD, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12680)  100 
 
 		 880 aa  1834    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122406  normal  0.163465 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45419  predicted protein  36.18 
 
 		 702 aa  426  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22367  CULlin protein 3  31.36 
 
 		 762 aa  320  7e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264277  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03939  SCF ubiquitin ligase subunit CulC, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08220)  29 
 
 		 823 aa  310  8e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00875329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50090  predicted protein  29.43 
 
 		 745 aa  290  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01019  SCF ubiquitin ligase complex subunit CulA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12960)  30.66 
 
 		 764 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33783  predicted protein  27.74 
 
 		 786 aa  266  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.365007 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29317  CULlin protein 1  27.13 
 
 		 741 aa  258  5e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291642  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04260  ubiquitin-protein ligase, putative  38.29 
 
 		 811 aa  254  5.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229428  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04610  ubiquitin-protein ligase, putative  40.23 
 
 		 808 aa  243  1e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44571  CULlin protein 4  37.06 
 
 		 821 aa  224  8e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.457132  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01140  ubiquitin-protein ligase, putative  25.79 
 
 		 775 aa  210  8e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29770  ubiquitin ligase (cullin) of SCF involved in cell cycle control  25.41 
 
 		 776 aa  194  7e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51711  predicted protein  24.04 
 
 		 736 aa  183  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00408227  normal  0.0250071 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80515  cullin, ubiquitin ligase activity  27.82 
 
 		 783 aa  139  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.205176 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47273  predicted protein  30.99 
 
 		 767 aa  65.1  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.662856  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10258  anaphase-promoting complex subunit ApcB, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05210)  26.2 
 
 		 918 aa  56.2  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44236  predicted protein  23.94 
 
 		 866 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963613  normal  0.0380429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>