16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29770 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_29770  ubiquitin ligase (cullin) of SCF involved in cell cycle control  100 
 
 		 776 aa  1615    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01019  SCF ubiquitin ligase complex subunit CulA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12960)  37.11 
 
 		 764 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01140  ubiquitin-protein ligase, putative  35.19 
 
 		 775 aa  486  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22367  CULlin protein 3  26.85 
 
 		 762 aa  250  7e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264277  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50090  predicted protein  25.19 
 
 		 745 aa  242  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29317  CULlin protein 1  25.61 
 
 		 741 aa  231  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291642  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45419  predicted protein  26.08 
 
 		 702 aa  225  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33783  predicted protein  26.16 
 
 		 786 aa  217  8e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.365007 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03939  SCF ubiquitin ligase subunit CulC, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08220)  25.2 
 
 		 823 aa  194  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00875329  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10008  ubiquitin ligase subunit CulD, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12680)  25.41 
 
 		 880 aa  194  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122406  normal  0.163465 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04610  ubiquitin-protein ligase, putative  25.65 
 
 		 808 aa  182  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51711  predicted protein  24.64 
 
 		 736 aa  157  8e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00408227  normal  0.0250071 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80515  cullin, ubiquitin ligase activity  25.17 
 
 		 783 aa  120  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.205176 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04260  ubiquitin-protein ligase, putative  26.26 
 
 		 811 aa  118  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229428  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44571  CULlin protein 4  24.46 
 
 		 821 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.457132  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01120  expressed protein  21.67 
 
 		 241 aa  68.9  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>