17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44571 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44571  CULlin protein 4  100 
 
 		 821 aa  1701    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.457132  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45419  predicted protein  36.25 
 
 		 702 aa  278  3e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10008  ubiquitin ligase subunit CulD, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12680)  37.06 
 
 		 880 aa  224  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122406  normal  0.163465 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22367  CULlin protein 3  27.78 
 
 		 762 aa  204  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264277  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33783  predicted protein  36.39 
 
 		 786 aa  197  9e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.365007 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29317  CULlin protein 1  31.33 
 
 		 741 aa  196  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291642  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04260  ubiquitin-protein ligase, putative  36.73 
 
 		 811 aa  187  7e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229428  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03939  SCF ubiquitin ligase subunit CulC, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08220)  31.44 
 
 		 823 aa  163  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00875329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50090  predicted protein  29.22 
 
 		 745 aa  163  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01019  SCF ubiquitin ligase complex subunit CulA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12960)  28.31 
 
 		 764 aa  160  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01140  ubiquitin-protein ligase, putative  30.2 
 
 		 775 aa  159  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04610  ubiquitin-protein ligase, putative  32.79 
 
 		 808 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29770  ubiquitin ligase (cullin) of SCF involved in cell cycle control  24.46 
 
 		 776 aa  117  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51711  predicted protein  25.4 
 
 		 736 aa  95.5  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00408227  normal  0.0250071 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80515  cullin, ubiquitin ligase activity  24.01 
 
 		 783 aa  85.9  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.205176 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10258  anaphase-promoting complex subunit ApcB, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05210)  25.7 
 
 		 918 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44236  predicted protein  23.2 
 
 		 866 aa  44.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963613  normal  0.0380429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>