16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80515 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_80515  cullin, ubiquitin ligase activity  100 
 
 		 783 aa  1592    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.205176 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45419  predicted protein  25.9 
 
 		 702 aa  152  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10008  ubiquitin ligase subunit CulD, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12680)  27.82 
 
 		 880 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122406  normal  0.163465 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04260  ubiquitin-protein ligase, putative  29.46 
 
 		 811 aa  138  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229428  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29770  ubiquitin ligase (cullin) of SCF involved in cell cycle control  25.17 
 
 		 776 aa  120  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50090  predicted protein  24.32 
 
 		 745 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01019  SCF ubiquitin ligase complex subunit CulA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12960)  25.25 
 
 		 764 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22367  CULlin protein 3  23.82 
 
 		 762 aa  114  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264277  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01140  ubiquitin-protein ligase, putative  28.49 
 
 		 775 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29317  CULlin protein 1  24.46 
 
 		 741 aa  108  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291642  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33783  predicted protein  28.88 
 
 		 786 aa  96.3  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.365007 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44571  CULlin protein 4  24.01 
 
 		 821 aa  85.9  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.457132  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03939  SCF ubiquitin ligase subunit CulC, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08220)  25.21 
 
 		 823 aa  83.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00875329  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04610  ubiquitin-protein ligase, putative  23.74 
 
 		 808 aa  81.3  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51711  predicted protein  22.9 
 
 		 736 aa  68.6  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00408227  normal  0.0250071 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02340  ubiquitin-protein ligase, putative  30 
 
 		 656 aa  51.6  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>