18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_45419 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_45419  predicted protein  100 
 
 		 702 aa  1437    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10008  ubiquitin ligase subunit CulD, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12680)  36.18 
 
 		 880 aa  437  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122406  normal  0.163465 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33783  predicted protein  33.81 
 
 		 786 aa  373  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.365007 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22367  CULlin protein 3  34.13 
 
 		 762 aa  361  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264277  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50090  predicted protein  34.3 
 
 		 745 aa  358  9.999999999999999e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03939  SCF ubiquitin ligase subunit CulC, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08220)  31.41 
 
 		 823 aa  343  7e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00875329  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01019  SCF ubiquitin ligase complex subunit CulA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12960)  32.32 
 
 		 764 aa  325  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29317  CULlin protein 1  32.3 
 
 		 741 aa  325  3e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291642  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01140  ubiquitin-protein ligase, putative  30.66 
 
 		 775 aa  306  6e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04610  ubiquitin-protein ligase, putative  31.69 
 
 		 808 aa  303  6.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44571  CULlin protein 4  36.25 
 
 		 821 aa  278  3e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.457132  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04260  ubiquitin-protein ligase, putative  32.85 
 
 		 811 aa  273  6e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229428  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29770  ubiquitin ligase (cullin) of SCF involved in cell cycle control  26.08 
 
 		 776 aa  238  3e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51711  predicted protein  24.1 
 
 		 736 aa  190  5.999999999999999e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00408227  normal  0.0250071 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80515  cullin, ubiquitin ligase activity  25.9 
 
 		 783 aa  158  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.205176 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36569  predicted protein  29.63 
 
 		 166 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10258  anaphase-promoting complex subunit ApcB, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05210)  26.05 
 
 		 918 aa  55.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47273  predicted protein  22.5 
 
 		 767 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.662856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>