12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47273 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47273  predicted protein  100 
 
 		 767 aa  1598    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.662856  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44236  predicted protein  39.39 
 
 		 866 aa  226  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963613  normal  0.0380429 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10258  anaphase-promoting complex subunit ApcB, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05210)  28.18 
 
 		 918 aa  212  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02340  ubiquitin-protein ligase, putative  30.37 
 
 		 656 aa  197  7e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664137  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87387  predicted protein  26.32 
 
 		 830 aa  162  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.929125 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10008  ubiquitin ligase subunit CulD, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12680)  30.99 
 
 		 880 aa  65.1  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122406  normal  0.163465 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04260  ubiquitin-protein ligase, putative  29.75 
 
 		 811 aa  53.1  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229428  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50090  predicted protein  24.36 
 
 		 745 aa  52.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22367  CULlin protein 3  21.39 
 
 		 762 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264277  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33783  predicted protein  26.77 
 
 		 786 aa  51.2  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.365007 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01019  SCF ubiquitin ligase complex subunit CulA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12960)  22.17 
 
 		 764 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45419  predicted protein  22.28 
 
 		 702 aa  47.8  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>