17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG04260 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006692  CNG04260  ubiquitin-protein ligase, putative  100 
 
 		 811 aa  1672    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229428  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45419  predicted protein  33.06 
 
 		 702 aa  274  5.000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10008  ubiquitin ligase subunit CulD, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12680)  38.29 
 
 		 880 aa  254  5.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122406  normal  0.163465 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03939  SCF ubiquitin ligase subunit CulC, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08220)  35.82 
 
 		 823 aa  224  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00875329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33783  predicted protein  33.88 
 
 		 786 aa  203  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.365007 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22367  CULlin protein 3  33.93 
 
 		 762 aa  190  7e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264277  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50090  predicted protein  31.01 
 
 		 745 aa  191  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44571  CULlin protein 4  36.73 
 
 		 821 aa  187  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.457132  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29317  CULlin protein 1  32.98 
 
 		 741 aa  181  4.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291642  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01019  SCF ubiquitin ligase complex subunit CulA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12960)  31.98 
 
 		 764 aa  174  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04610  ubiquitin-protein ligase, putative  32.42 
 
 		 808 aa  172  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51711  predicted protein  28.17 
 
 		 736 aa  157  8e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00408227  normal  0.0250071 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01140  ubiquitin-protein ligase, putative  28.85 
 
 		 775 aa  157  8e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80515  cullin, ubiquitin ligase activity  29.46 
 
 		 783 aa  138  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.205176 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29770  ubiquitin ligase (cullin) of SCF involved in cell cycle control  26.26 
 
 		 776 aa  117  6.9999999999999995e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47273  predicted protein  29.61 
 
 		 767 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.662856  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87387  predicted protein  26.34 
 
 		 830 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.929125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>