15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG04610 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006692  CNG04610  ubiquitin-protein ligase, putative  100 
 
 		 808 aa  1661    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03939  SCF ubiquitin ligase subunit CulC, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08220)  36.26 
 
 		 823 aa  484  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00875329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22367  CULlin protein 3  34.17 
 
 		 762 aa  389  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264277  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33783  predicted protein  32.13 
 
 		 786 aa  372  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.365007 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45419  predicted protein  32.08 
 
 		 702 aa  325  1e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10008  ubiquitin ligase subunit CulD, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12680)  28.38 
 
 		 880 aa  296  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122406  normal  0.163465 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29317  CULlin protein 1  29 
 
 		 741 aa  282  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291642  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50090  predicted protein  27.23 
 
 		 745 aa  280  6e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51711  predicted protein  28.59 
 
 		 736 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00408227  normal  0.0250071 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01019  SCF ubiquitin ligase complex subunit CulA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12960)  26.35 
 
 		 764 aa  229  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01140  ubiquitin-protein ligase, putative  25.84 
 
 		 775 aa  224  4e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29770  ubiquitin ligase (cullin) of SCF involved in cell cycle control  25.95 
 
 		 776 aa  217  8e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04260  ubiquitin-protein ligase, putative  32.35 
 
 		 811 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229428  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44571  CULlin protein 4  30.61 
 
 		 821 aa  148  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.457132  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80515  cullin, ubiquitin ligase activity  25.43 
 
 		 783 aa  99.8  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.205176 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>