165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16243 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_16243  predicted protein  100 
 
 
91 aa  186  8e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  45.05 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  42.55 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  43.96 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0509  ApaG  42.7 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2568  ApaG  42.7 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0537  ApaG  42.7 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371391  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1237  ApaG  43.9 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2695  ApaG  44.58 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0536  ApaG  42.7 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.680201  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0641  ApaG  42.7 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0937  ApaG  42.7 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3552  ApaG  42.7 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3579  ApaG  42.7 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1907  ApaG  42.7 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  42.86 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.560513 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00054  hypothetical protein  42.86 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  42.86 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  42.86 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3571  ApaG  42.7 
 
 
185 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3624  ApaG  41.57 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  42.86 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  42.86 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  45.05 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  42.86 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  42.86 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  42.86 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  42.86 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  42.86 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  41.76 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  43.82 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  45.05 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1033  ApaG  45.78 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0466  ApaG  41.57 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0442  ApaG  41.57 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3493  ApaG  43.37 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00288381  decreased coverage  0.0000301407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0723  ApaG  45.05 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2857  ApaG  41.57 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.93069  normal  0.818828 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0829  ApaG  44.58 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00542439  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  41.57 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2906  ApaG  41.57 
 
 
185 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3445  ApaG  42.86 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0773  ApaG  42.86 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0328045  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3574  ApaG  42.86 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  43.01 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  43.01 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  43.82 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  43.01 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.574173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  43.01 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  43.01 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  45.05 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  42.7 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0464  ApaG  42.17 
 
 
124 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  40.66 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  39.76 
 
 
130 aa  60.8  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  43.82 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  39.56 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  55.22 
 
 
237 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0586  ApaG  43.9 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  38.55 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  42.86 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  55.22 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  42.7 
 
 
130 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  40.96 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  37.35 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  40 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1279  ApaG domain protein  38.75 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.638394  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  39.76 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  38.2 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3468  ApaG  38.1 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  39.76 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  39.76 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  41.57 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  41.57 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_002978  WD1141  ApaG  40.48 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  46.34 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0470  ApaG  40 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.327059 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0921  ApaG  39.56 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.116399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  40.66 
 
 
129 aa  57.4  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  39.56 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  36.14 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  47.95 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  39.33 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  45.12 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2661  ApaG  40.24 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00116294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  39.56 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  39.33 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  35.71 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  42.7 
 
 
211 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0247  ApaG domain protein  42.68 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  45.12 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2660  ApaG  40.96 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  39.78 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  39.33 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3900  ApaG domain-containing protein  41.98 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  39.74 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  39.56 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  38.55 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  39.76 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0721  ApaG  41.46 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>