170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3900 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3900  ApaG domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  267  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3468  ApaG  60.48 
 
 		 124 aa  173  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  61.11 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  62.1 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  61.29 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2857  ApaG  62.1 
 
 		 124 aa  167  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.93069  normal  0.818828 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  61.29 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  61.29 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0464  ApaG  59.68 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0536  ApaG  61.29 
 
 		 124 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.680201  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3624  ApaG  60.48 
 
 		 124 aa  164  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0442  ApaG  60.48 
 
 		 124 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0641  ApaG  61.29 
 
 		 124 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0937  ApaG  61.29 
 
 		 124 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3552  ApaG  61.29 
 
 		 124 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3579  ApaG  61.29 
 
 		 124 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1907  ApaG  61.29 
 
 		 124 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2906  ApaG  61.29 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3493  ApaG  59.68 
 
 		 124 aa  164  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00288381  decreased coverage  0.0000301407 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0466  ApaG  60.48 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2568  ApaG  60.48 
 
 		 124 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0537  ApaG  60.48 
 
 		 124 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3571  ApaG  61.29 
 
 		 185 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0509  ApaG  59.68 
 
 		 124 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  60.68 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4467  ApaG  58.97 
 
 		 131 aa  153  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2695  ApaG  55.65 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  56.45 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  56.45 
 
 		 124 aa  149  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0721  ApaG  55.83 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  57.14 
 
 		 136 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0349  ApaG  56.41 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.093684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0531  ApaG  53.85 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  54.62 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  55 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  54.62 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0360  ApaG  60.58 
 
 		 137 aa  140  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  58.93 
 
 		 127 aa  140  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0586  ApaG  54.7 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  55.08 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  50.79 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  54.24 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  51.26 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  50.93 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  52.99 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  52.99 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  47.9 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  49.15 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  45.24 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  50.43 
 
 		 142 aa  120  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  49.15 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  50.85 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  48.31 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  46.83 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1289  ApaG  47.54 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1353  ApaG  47.54 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.214186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4173  ApaG  48.74 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  49.17 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  44.44 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  45.24 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  45.24 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  45.24 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4031  ApaG  47.06 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00953692  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  49.11 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  51.38 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  44.44 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  45 
 
 		 123 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4147  ApaG  49.56 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0310361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  50 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  45.45 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  46.02 
 
 		 130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  48.65 
 
 		 130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  50 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  45.08 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  47.54 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  47.75 
 
 		 211 aa  107  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  45.53 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0241  ApaG  50.42 
 
 		 126 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00054  hypothetical protein  40.32 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  40.32 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  40.32 
 
 		 125 aa  105  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.574173 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  40.32 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  40.32 
 
 		 125 aa  105  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  40.32 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  40.32 
 
 		 125 aa  105  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  40.32 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  40.32 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  40.32 
 
 		 125 aa  105  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  40.32 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  40.32 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  40.32 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  40.32 
 
 		 125 aa  105  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  42.98 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  39.52 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03415  ApaG  45.16 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250185  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  48.21 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  46.43 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  45 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  49.54 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  49.54 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>