25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2327 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2378  S-layer domain protein  99.01 
 
 
406 aa  813    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2327  S-layer domain protein  100 
 
 
406 aa  823    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4625  S-layer domain protein  54.57 
 
 
408 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0607  S-layer domain-containing protein  46.24 
 
 
461 aa  357  2.9999999999999997e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3184  S-layer region-like  46.87 
 
 
445 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0178672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2630  S-layer region-like protein, putative  42.08 
 
 
460 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1417  hypothetical protein  52.75 
 
 
327 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0372  S-layer region-like  51.26 
 
 
379 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3325  S-layer domain protein  37.11 
 
 
262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2792  S-layer domain protein  37.11 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.557365  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  26.7 
 
 
223 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  26.67 
 
 
1495 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2253  S-layer domain protein  22.62 
 
 
757 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.690122  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1979  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.15 
 
 
599 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  26.15 
 
 
599 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  27.52 
 
 
558 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0410  S-layer domain protein  30.7 
 
 
750 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.208061 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  30.41 
 
 
693 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  28.21 
 
 
1174 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.49 
 
 
539 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000635651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  25.79 
 
 
932 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  29.05 
 
 
1081 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  24.61 
 
 
1013 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.65 
 
 
1661 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  27.18 
 
 
1042 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>