11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0372 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0372  S-layer region-like  100 
 
 
379 aa  761    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0607  S-layer domain-containing protein  53.57 
 
 
461 aa  236  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4625  S-layer domain protein  51.48 
 
 
408 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2378  S-layer domain protein  51.68 
 
 
406 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3184  S-layer region-like  51.3 
 
 
445 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0178672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2327  S-layer domain protein  51.26 
 
 
406 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2630  S-layer region-like protein, putative  45.21 
 
 
460 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1417  hypothetical protein  45.54 
 
 
327 aa  193  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2792  S-layer domain protein  29.1 
 
 
262 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.557365  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3325  S-layer domain protein  29.1 
 
 
262 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2253  S-layer domain protein  28.57 
 
 
757 aa  53.5  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.690122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>