15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3184 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3184  S-layer region-like  100 
 
 
445 aa  898    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0178672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0607  S-layer domain-containing protein  59.4 
 
 
461 aa  525  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2327  S-layer domain protein  46.87 
 
 
406 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2378  S-layer domain protein  47.1 
 
 
406 aa  358  9e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4625  S-layer domain protein  45.41 
 
 
408 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2630  S-layer region-like protein, putative  41.98 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0372  S-layer region-like  51.3 
 
 
379 aa  246  6.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1417  hypothetical protein  49.12 
 
 
327 aa  226  7e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2792  S-layer domain protein  34.45 
 
 
262 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.557365  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3325  S-layer domain protein  34.45 
 
 
262 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  27.19 
 
 
1013 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  27.37 
 
 
932 aa  46.6  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  28.5 
 
 
1174 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0683  S-layer domain protein  28.18 
 
 
412 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.37 
 
 
995 aa  43.1  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>