17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4625 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4625  S-layer domain protein  100 
 
 
408 aa  828    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2378  S-layer domain protein  54.57 
 
 
406 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2327  S-layer domain protein  54.57 
 
 
406 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0607  S-layer domain-containing protein  44.25 
 
 
461 aa  356  3.9999999999999996e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3184  S-layer region-like  45.41 
 
 
445 aa  339  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0178672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2630  S-layer region-like protein, putative  41.01 
 
 
460 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1417  hypothetical protein  51.38 
 
 
327 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0372  S-layer region-like  51.48 
 
 
379 aa  229  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2792  S-layer domain protein  35.94 
 
 
262 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.557365  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3325  S-layer domain protein  34.38 
 
 
262 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0410  S-layer domain protein  28.73 
 
 
750 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.208061 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  23.61 
 
 
1495 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1979  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.66 
 
 
599 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  29.66 
 
 
599 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  27.4 
 
 
558 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1943  S-layer domain protein  29.45 
 
 
277 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00316306  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0683  S-layer domain protein  34.59 
 
 
412 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>