11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2630 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2630  S-layer region-like protein, putative  100 
 
 
460 aa  913    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0607  S-layer domain-containing protein  40.76 
 
 
461 aa  299  7e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3184  S-layer region-like  41.98 
 
 
445 aa  295  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0178672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2327  S-layer domain protein  42.08 
 
 
406 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2378  S-layer domain protein  41.53 
 
 
406 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4625  S-layer domain protein  41.01 
 
 
408 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221047 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1417  hypothetical protein  53.12 
 
 
327 aa  226  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0372  S-layer region-like  45.21 
 
 
379 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2792  S-layer domain protein  32.51 
 
 
262 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.557365  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3325  S-layer domain protein  33.5 
 
 
262 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  28.5 
 
 
1042 aa  43.1  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>