23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2378 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2378  S-layer domain protein  100 
 
 		 406 aa  823    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2327  S-layer domain protein  99.01 
 
 		 406 aa  813    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4625  S-layer domain protein  54.81 
 
 		 408 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0607  S-layer domain-containing protein  46.02 
 
 		 461 aa  360  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3184  S-layer region-like  47.1 
 
 		 445 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0178672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2630  S-layer region-like protein, putative  41.84 
 
 		 460 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1417  hypothetical protein  52.75 
 
 		 327 aa  246  6e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0372  S-layer region-like  51.68 
 
 		 379 aa  226  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3325  S-layer domain protein  37.63 
 
 		 262 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2792  S-layer domain protein  37.63 
 
 		 262 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.557365  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2253  S-layer domain protein  23.21 
 
 		 757 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.690122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  26.21 
 
 		 223 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  26.67 
 
 		 1495 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0410  S-layer domain protein  30.7 
 
 		 750 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.208061 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  26.32 
 
 		 932 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  27.67 
 
 		 1042 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  30.41 
 
 		 693 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  27.15 
 
 		 558 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.22 
 
 		 995 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1979  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.84 
 
 		 599 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  28.21 
 
 		 1174 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  27.13 
 
 		 599 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.96 
 
 		 539 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000635651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>