10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1417 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1417  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  643    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2327  S-layer domain protein  49.2 
 
 
406 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2378  S-layer domain protein  50.86 
 
 
406 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4625  S-layer domain protein  51.05 
 
 
408 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0607  S-layer domain-containing protein  52 
 
 
461 aa  237  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2630  S-layer region-like protein, putative  49.44 
 
 
460 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3184  S-layer region-like  47.77 
 
 
445 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0178672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0372  S-layer region-like  43.41 
 
 
379 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3325  S-layer domain protein  29.76 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2792  S-layer domain protein  31.22 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.557365  normal  0.576583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>