131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_21001 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_21001  hypothetical protein  100 
 
 		 42 aa  84.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  92.31 
 
 		 81 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  90 
 
 		 81 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  87.5 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  87.5 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  85 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  85 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  85 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  85 
 
 		 81 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  87.5 
 
 		 81 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  87.5 
 
 		 81 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  81.58 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  77.5 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  75 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  76.92 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  76.92 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  77.5 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  75 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  67.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  67.5 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  72.5 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  70 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  65.79 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  65.79 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  65.79 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  65.79 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  65.79 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  61.54 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  65.79 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  61.54 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  65.79 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  64.29 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  66.67 
 
 		 74 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  64.1 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  64.29 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  66.67 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  62.16 
 
 		 200 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  64.1 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  64.1 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  57.5 
 
 		 185 aa  50.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  59.46 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  61.54 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  57.89 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  62.5 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  57.89 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  60.53 
 
 		 195 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  67.57 
 
 		 294 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  55.26 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  62.5 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  62.5 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  60 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  61.54 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  67.57 
 
 		 294 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  65 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  65 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  65 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  65 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  56.41 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  65 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  56.1 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  65 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  56.76 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  65 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  70.97 
 
 		 305 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  65 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  65 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  65 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  65 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  63.16 
 
 		 72 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  52.5 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  57.14 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  57.14 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  57.14 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  57.5 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  50 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  50 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  57.5 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  57.89 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  60.61 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  57.58 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  60.53 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  57.89 
 
 		 192 aa  47  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  63.16 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  57.58 
 
 		 186 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1377  NifU domain-containing protein  68.75 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000465416  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1514  NifU domain protein  71.88 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  55 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  54.29 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  64.52 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  51.43 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  55 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  68.75 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  50 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  55.26 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  51.52 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  50 
 
 		 188 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  51.52 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.63 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  60.61 
 
 		 309 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>