20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3205 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3205  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 806 aa  1628    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122547  normal  0.277345 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0736  TPR repeat-containing protein  36.69 
 
 		 552 aa  290  7e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.325309  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0526  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 603 aa  241  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1376  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  25.74 
 
 		 575 aa  117  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 2262 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 729 aa  54.7  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1675  hypothetical protein  30.91 
 
 		 355 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 		 557 aa  50.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  27.74 
 
 		 673 aa  48.9  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25 
 
 		 732 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 827 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  20.85 
 
 		 3145 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  24.83 
 
 		 2059 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  36.11 
 
 		 349 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.11 
 
 		 573 aa  45.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.68 
 
 		 878 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 1094 aa  44.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  27.98 
 
 		 603 aa  44.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.14 
 
 		 553 aa  44.3  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 3560 aa  44.3  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>