21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_25194 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009365  OSTLU_25194  predicted protein  100 
 
 
1266 aa  2573    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.551119  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45350  predicted protein  31.59 
 
 
1335 aa  295  3e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  26.44 
 
 
390 aa  53.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  27.9 
 
 
381 aa  50.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0037  RecF/RecN/SMC domain-containing protein  21.72 
 
 
638 aa  50.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000359393  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  24.44 
 
 
1016 aa  49.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  25 
 
 
1007 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  23.76 
 
 
693 aa  46.6  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  30.5 
 
 
270 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  27.27 
 
 
1008 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 
382 aa  46.2  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 
382 aa  46.2  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  27.24 
 
 
381 aa  45.8  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0262  ABC transporter related  41.46 
 
 
243 aa  45.8  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.888002 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  26.19 
 
 
1008 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0933  ABC transporter related  35.92 
 
 
508 aa  45.8  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0287  ABC transporter related  38.64 
 
 
257 aa  45.4  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1288  ABC transporter related  30.36 
 
 
253 aa  45.4  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1024  ABC transporter related  35.23 
 
 
362 aa  45.1  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  32.32 
 
 
481 aa  45.1  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
353 aa  44.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>