15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45350 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45350  predicted protein  100 
 
 		 1335 aa  2751    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_25194  predicted protein  31.59 
 
 		 1266 aa  294  7e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.551119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  24.9 
 
 		 390 aa  55.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  29.71 
 
 		 1031 aa  54.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  24.41 
 
 		 864 aa  50.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  40.32 
 
 		 392 aa  50.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  26.51 
 
 		 386 aa  48.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  31.25 
 
 		 693 aa  47.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  28.5 
 
 		 381 aa  47.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  25.95 
 
 		 994 aa  46.6  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  24.69 
 
 		 375 aa  46.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  23.96 
 
 		 406 aa  45.1  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2085  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.44 
 
 		 318 aa  45.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  23.16 
 
 		 381 aa  45.1  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  26.05 
 
 		 586 aa  45.1  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>