More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0029 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0029  fumarase  100 
 
 		 458 aa  939    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1531  fumarate hydratase  59.78 
 
 		 462 aa  557  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000952878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1120  fumarate hydratase  54.42 
 
 		 456 aa  508  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0847  fumarate hydratase  55.56 
 
 		 468 aa  504  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000101686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  54.13 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  54.13 
 
 		 462 aa  498  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  54.13 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  54.13 
 
 		 462 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  54.35 
 
 		 462 aa  498  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  54.13 
 
 		 462 aa  498  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  54.13 
 
 		 462 aa  498  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  54.13 
 
 		 462 aa  498  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  53.91 
 
 		 462 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  54.13 
 
 		 462 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  53.91 
 
 		 462 aa  498  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  51.65 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  52.17 
 
 		 468 aa  490  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  52.75 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  52.97 
 
 		 463 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  52.75 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  53.9 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2054  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  51.62 
 
 		 474 aa  488  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  52.09 
 
 		 463 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  52.83 
 
 		 466 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  52.71 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  53.93 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  52.49 
 
 		 463 aa  481  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 470 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  51.75 
 
 		 465 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  52.74 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 465 aa  478  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  52.75 
 
 		 463 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1387  fumarate hydratase  51.32 
 
 		 461 aa  478  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.987993  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  51.84 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  52.75 
 
 		 463 aa  478  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4786  fumarate hydratase  55.34 
 
 		 461 aa  475  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.183697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  50.55 
 
 		 467 aa  475  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  52.06 
 
 		 463 aa  478  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 461 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  51.21 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  51.21 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  52.7 
 
 		 466 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0904  fumarate hydratase, class II  53.91 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  50.55 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1939  fumarate hydratase  51.54 
 
 		 461 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1905  fumarate hydratase  51.54 
 
 		 461 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0427155  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  51.96 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  50.77 
 
 		 467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  51.4 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  50.99 
 
 		 467 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  50.99 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  51.42 
 
 		 462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  50.77 
 
 		 467 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  50.97 
 
 		 467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 631 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  50.99 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 466 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2816  fumarate hydratase, class II  51.96 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 464 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 464 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 464 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1185  fumarate hydratase, class II  51.09 
 
 		 462 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 464 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  49.24 
 
 		 464 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0542  fumarate hydratase, class II  51.09 
 
 		 467 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0965  fumarate hydratase, class II  51.62 
 
 		 465 aa  462  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  49.45 
 
 		 465 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0598  fumarate hydratase, class II  50.87 
 
 		 467 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0537  fumarate hydratase, class II  50.65 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  49.23 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0516  fumarate hydratase, class II  50.87 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  48.8 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  49.03 
 
 		 464 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3801  fumarate hydratase, class II  50.87 
 
 		 467 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  49.45 
 
 		 465 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  48.79 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1795  fumarate hydratase, class II  50.22 
 
 		 465 aa  455  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  49.23 
 
 		 465 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  49.67 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1627  fumarate hydratase class II  51.2 
 
 		 463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1049  fumarate hydratase  49.24 
 
 		 463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.62891  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  51.19 
 
 		 466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>