82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0717 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0717  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  100 
 
 
480 aa  974    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  34.97 
 
 
318 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  33.88 
 
 
315 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  30.27 
 
 
338 aa  87.4  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.79 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  29.17 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  28.87 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  26.1 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  29.24 
 
 
340 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  29.24 
 
 
340 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  29.73 
 
 
339 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  29.13 
 
 
692 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  25 
 
 
312 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  27.47 
 
 
333 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  28.87 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  27.72 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  28.32 
 
 
331 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  31.54 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  29.03 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  27.49 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  28.32 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  25.31 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  26.04 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  27.91 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  26.9 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  26.92 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  27.17 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  31.25 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  26.4 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  26.82 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  29.09 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  26.99 
 
 
332 aa  67  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  27.33 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  25.38 
 
 
318 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  25.38 
 
 
318 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  27.27 
 
 
347 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  27.27 
 
 
347 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  26.32 
 
 
334 aa  63.9  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  35.16 
 
 
326 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  23.03 
 
 
297 aa  62.4  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0494  phosphate binding protein  26.47 
 
 
348 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  26.23 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  30.28 
 
 
271 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  27.17 
 
 
669 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  26.99 
 
 
666 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  29.86 
 
 
272 aa  58.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  22.78 
 
 
340 aa  57  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.45 
 
 
325 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  28.26 
 
 
957 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  21.66 
 
 
302 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  28.03 
 
 
651 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  26.45 
 
 
327 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  26.45 
 
 
327 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2048  hypothetical protein  30.43 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6423  putative phosphate-binding protein of phosphate ABC transporter  23.85 
 
 
804 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81421  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  26.83 
 
 
935 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  26.28 
 
 
271 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  25 
 
 
331 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1794  phosphate-binding protein PstS-like protein  33.07 
 
 
316 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  25 
 
 
331 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  19.58 
 
 
305 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  19.58 
 
 
305 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  19.68 
 
 
305 aa  47.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  25.74 
 
 
329 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  19.58 
 
 
305 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  19.58 
 
 
305 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  25 
 
 
327 aa  47  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  19.58 
 
 
305 aa  47  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  29.41 
 
 
290 aa  47  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  25.93 
 
 
272 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  19.87 
 
 
305 aa  47  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  25.71 
 
 
331 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  26.92 
 
 
290 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  19.75 
 
 
305 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2358  ABC transporter periplasmic phosphate-binding protein  23.53 
 
 
342 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  28.42 
 
 
519 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  19.11 
 
 
305 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  36.36 
 
 
270 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  29 
 
 
341 aa  43.9  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1692  phosphate-binding protein PstS-like protein  25.97 
 
 
319 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1711  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  25.97 
 
 
319 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2837  hypothetical protein  24.31 
 
 
395 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.126303  normal  0.152779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>