219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0297 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0297  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
232 aa  463  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8021  hypothetical protein  41.06 
 
 
322 aa  141  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0867  Redoxin domain protein  38.89 
 
 
353 aa  141  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  26.73 
 
 
170 aa  62  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5700  hypothetical protein  35.9 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.431597  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  27.62 
 
 
173 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3124  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
170 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3452  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
165 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.61 
 
 
178 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.85 
 
 
166 aa  59.3  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3254  hypothetical protein  26.61 
 
 
172 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1789  Redoxin domain protein  29.25 
 
 
165 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  28.3 
 
 
173 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  29.25 
 
 
165 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  33.64 
 
 
248 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  28.28 
 
 
182 aa  56.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  28.44 
 
 
211 aa  56.2  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  26.42 
 
 
188 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  28.12 
 
 
165 aa  55.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.65 
 
 
187 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1155  redoxin  23.62 
 
 
137 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  29.46 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  33.04 
 
 
189 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  26.61 
 
 
166 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  25.23 
 
 
170 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  22.77 
 
 
167 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2293  thioredoxin family protein  31.11 
 
 
183 aa  53.1  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  26.92 
 
 
171 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  28.04 
 
 
171 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  29.36 
 
 
182 aa  52.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.1 
 
 
199 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  28.44 
 
 
176 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.93 
 
 
188 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.45 
 
 
170 aa  52  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.69 
 
 
169 aa  52  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3250  hypothetical protein  25 
 
 
165 aa  52  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  30.56 
 
 
202 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  29.09 
 
 
192 aa  51.6  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  25.47 
 
 
168 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  26.85 
 
 
156 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  26.85 
 
 
165 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  24.11 
 
 
173 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  26.85 
 
 
165 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  30.56 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  30.56 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  30.53 
 
 
174 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  27.06 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  30.56 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  29.84 
 
 
183 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  23.58 
 
 
437 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  29.09 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1834  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.63 
 
 
381 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.77 
 
 
169 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  30.56 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  30.56 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  30.56 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  24.77 
 
 
168 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  22.22 
 
 
173 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  22.22 
 
 
173 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31 
 
 
168 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  26.61 
 
 
170 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  24.3 
 
 
173 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_002950  PG1084  thioredoxin family protein  31.31 
 
 
358 aa  49.3  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.492261 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  23.36 
 
 
173 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1572  hypothetical protein  30.53 
 
 
194 aa  49.3  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  27.68 
 
 
180 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.07 
 
 
178 aa  49.3  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  29.03 
 
 
184 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.61 
 
 
288 aa  49.3  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  23.36 
 
 
173 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  23.36 
 
 
173 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  24.14 
 
 
433 aa  48.5  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  28.42 
 
 
173 aa  48.5  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.43 
 
 
178 aa  48.5  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.1 
 
 
195 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.21 
 
 
189 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  23.36 
 
 
173 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  26.61 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.1 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0709  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  29.2 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.704361  normal  0.894516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.22 
 
 
184 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  25.89 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  21.1 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.96 
 
 
179 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  37.31 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  23.36 
 
 
173 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  29.7 
 
 
161 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  25.23 
 
 
329 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.02 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  28.18 
 
 
183 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  21.1 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.77 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  29.73 
 
 
173 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  26.36 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  22.94 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  27.27 
 
 
182 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 
182 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  26.79 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.19 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>