62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1283 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1482 bp  2938    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3743  general secretion pathway protein-related protein  100 
 
 		 906 bp  1505    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.122195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2973  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.52 
 
 		 1401 bp  1386    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0717724  normal  0.0172565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2232  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.38 
 
 		 1401 bp  1378    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000585875  normal  0.443218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2051  hypothetical protein  100 
 
 		 594 bp  1178    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00674757  decreased coverage  0.00196539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2049    100 
 
 		 2995 bp  1798    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0144762  decreased coverage  0.00465483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2048  general secretion pathway protein-related protein  100 
 
 		 816 bp  1618    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00486349  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0087  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.38 
 
 		 1401 bp  1378    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.52 
 
 		 1401 bp  1386    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.52 
 
 		 1401 bp  1386    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.425839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1282  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.52 
 
 		 1401 bp  1386    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124375  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1283    100 
 
 		 4742 bp  9400    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430984  normal  0.62952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1284  hypothetical protein  100 
 
 		 594 bp  1178    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0426406  normal  0.52128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1286  general secretion pathway protein-related protein  100 
 
 		 816 bp  1618    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.385442  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1287  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1398 bp  1473    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324635  normal  0.577676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  99.66 
 
 		 1488 bp  2849    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3745  hypothetical protein  99.83 
 
 		 594 bp  1170    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118798  normal  0.183077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4398  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.52 
 
 		 1401 bp  1386    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.52 
 
 		 1401 bp  1386    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4519  general secretion pathway protein-related protein  100 
 
 		 816 bp  1618    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1482 bp  2938    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4521  hypothetical protein  100 
 
 		 594 bp  1178    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4945  general secretion pathway protein-related protein  95.44 
 
 		 816 bp  1314    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  89.31 
 
 		 1470 bp  1614    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.38 
 
 		 1401 bp  1378    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.198929  normal  0.0124292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4947  hypothetical protein  87.88 
 
 		 594 bp  607  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5571  AAA ATPase  81.38 
 
 		 816 bp  301  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5447  AAA ATPase  80.35 
 
 		 816 bp  248  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2927  AAA ATPase  80.8 
 
 		 816 bp  222  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600702  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2502  AAA ATPase  80.8 
 
 		 816 bp  222  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1689  AAA ATPase  80.8 
 
 		 816 bp  222  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0572  AAA ATPase  80.8 
 
 		 816 bp  222  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0555  AAA ATPase  80.8 
 
 		 816 bp  222  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  79.63 
 
 		 1569 bp  119  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  78.5 
 
 		 1533 bp  109  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2928  integrase catalytic subunit  79.58 
 
 		 1500 bp  105  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171579  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2501  integrase catalytic subunit  79.58 
 
 		 1500 bp  105  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1688  integrase catalytic subunit  79.58 
 
 		 1500 bp  105  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0571  integrase catalytic subunit  79.58 
 
 		 1500 bp  105  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0554    79.58 
 
 		 1167 bp  105  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12827  hypothetical protein  80.08 
 
 		 813 bp  99.6  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.12444e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2124  transposase IS116/IS110/IS902  89.83 
 
 		 1239 bp  69.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4122  transposase IS116/IS110/IS902  89.83 
 
 		 1239 bp  69.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3437  transposase IS116/IS110/IS902  89.83 
 
 		 1239 bp  69.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3436  transposase IS116/IS110/IS902  89.83 
 
 		 1239 bp  69.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  100 
 
 		 927 bp  65.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2366  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.87 
 
 		 1239 bp  61.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.87 
 
 		 1335 bp  61.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.87 
 
 		 1239 bp  61.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1024  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.87 
 
 		 1239 bp  61.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 2181 bp  56  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  94.44 
 
 		 1410 bp  56  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  94.29 
 
 		 1932 bp  54  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  94.29 
 
 		 1785 bp  54  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 3567 bp  52  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1327  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  100 
 
 		 3579 bp  50.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  96.55 
 
 		 1026 bp  50.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  96.55 
 
 		 1062 bp  50.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  96.55 
 
 		 1713 bp  50.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  96.55 
 
 		 825 bp  50.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  96.55 
 
 		 825 bp  50.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  96.55 
 
 		 1599 bp  50.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>