14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0554 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  87.63 
 
 		 1533 bp  1037    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0554    100 
 
 		 1167 bp  2313    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0571  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1500 bp  2313    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1688  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1500 bp  2313    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2501  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1500 bp  2313    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2928  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1500 bp  2313    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171579  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  84.65 
 
 		 1569 bp  767    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  79.52 
 
 		 1470 bp  119  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1283    79.58 
 
 		 4742 bp  105  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430984  normal  0.62952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  79.58 
 
 		 1482 bp  105  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2049    79.58 
 
 		 2995 bp  105  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0144762  decreased coverage  0.00465483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  79.58 
 
 		 1488 bp  105  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  79.58 
 
 		 1482 bp  105  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  84.56 
 
 		 1410 bp  103  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>