14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4521 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1284  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0426406  normal  0.52128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2051  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00674757  decreased coverage  0.00196539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3745  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118798  normal  0.183077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4521  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4947  hypothetical protein  86.29 
 
 
197 aa  315  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0551  hypothetical protein  57.65 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0570  hypothetical protein  57.65 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1687  hypothetical protein  57.65 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2500  hypothetical protein  57.65 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2929  hypothetical protein  57.65 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.395899  normal  0.248363 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5573  hypothetical protein  57.21 
 
 
206 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12825  hypothetical protein  51.79 
 
 
202 aa  149  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000925433  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5445  hypothetical protein  47.5 
 
 
86 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.86632  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13805  hypothetical protein  41 
 
 
108 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.562355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>