74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3778 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3778  ferredoxin  100 
 
 		 122 aa  251  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0287  ferredoxin  71.31 
 
 		 121 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0397  ferredoxin  59.02 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.449026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1751  putative 2Fe-2S ferredoxin protein  59.02 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2499  ferredoxin  55.74 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.809791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  55.08 
 
 		 302 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  54.24 
 
 		 301 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  54.24 
 
 		 301 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  53.39 
 
 		 302 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1188  ferredoxin  55.46 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000641343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2342  ferredoxin  50.43 
 
 		 115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0232  ferredoxin, 2Fe-2S  50 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1237  ferredoxin  55.65 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0193309 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1519  ferredoxin  55.65 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0937354  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1916  ferredoxin  46.67 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3149  ferredoxin  46.67 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39700  Ferredoxin  41.8 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0545  ferredoxin  41.38 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1449  ferredoxin  41.53 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1518  ferredoxin, putative  32.08 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0846747  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1236  ferredoxin  32.08 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0203128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.33 
 
 		 340 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4051  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.06 
 
 		 342 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.29 
 
 		 343 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.29 
 
 		 343 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.29 
 
 		 343 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.29 
 
 		 343 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.29 
 
 		 343 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.29 
 
 		 343 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.29 
 
 		 343 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.29 
 
 		 343 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.82 
 
 		 343 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.82 
 
 		 343 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.82 
 
 		 343 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.82 
 
 		 343 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.82 
 
 		 343 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.82 
 
 		 343 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.82 
 
 		 343 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18640  flavodoxin reductase family protein  37.8 
 
 		 355 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.74 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4333  putative ferredoxin--NAD(+) reductase  51.16 
 
 		 344 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.98 
 
 		 350 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  45.1 
 
 		 342 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.34 
 
 		 349 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3561  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.81 
 
 		 343 aa  42  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4637  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.81 
 
 		 343 aa  42  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.217006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.34 
 
 		 349 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3739  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  25.24 
 
 		 358 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184178  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1311  oxidoreductase FAD-binding region  31.37 
 
 		 340 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.577978  normal  0.18536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2827  putative ferredoxin--NAD(+) reductase  55.88 
 
 		 419 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.51 
 
 		 669 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.89 
 
 		 346 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.88 
 
 		 341 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2281  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.58 
 
 		 335 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.38 
 
 		 336 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3939  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase / oxidoreductase, NAD-dependent  35.56 
 
 		 558 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.98 
 
 		 354 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2703  ferredoxin  38.03 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  46 
 
 		 336 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.82 
 
 		 343 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.5 
 
 		 345 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.18 
 
 		 342 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  45.71 
 
 		 349 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4405  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  32.32 
 
 		 339 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35 
 
 		 354 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0377  ferredoxin  43.75 
 
 		 350 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32110  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer component  42.31 
 
 		 337 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4884  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer component  37.14 
 
 		 339 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.217527  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.33 
 
 		 343 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.22 
 
 		 348 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 		 343 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2110  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  50 
 
 		 335 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0440223  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.33 
 
 		 336 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.831402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  41.67 
 
 		 356 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>