22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0545 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0545  ferredoxin  100 
 
 		 118 aa  247  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1449  ferredoxin  56.41 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  47.41 
 
 		 302 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  47.41 
 
 		 301 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  46.55 
 
 		 302 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  46.55 
 
 		 301 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1188  ferredoxin  45.3 
 
 		 124 aa  107  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000641343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2342  ferredoxin  43.1 
 
 		 115 aa  103  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2499  ferredoxin  43.97 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.809791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1751  putative 2Fe-2S ferredoxin protein  44.44 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0397  ferredoxin  44.44 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.449026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0287  ferredoxin  42.74 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0232  ferredoxin, 2Fe-2S  44.92 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1519  ferredoxin  42.61 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0937354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1237  ferredoxin  42.61 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0193309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39700  Ferredoxin  40.17 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3778  ferredoxin  41.38 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3149  ferredoxin  36.75 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1916  ferredoxin  41.38 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1236  ferredoxin  28.18 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0203128 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1518  ferredoxin, putative  28.18 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0846747  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2391  ferredoxin  25.71 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>