27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2499 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2499  ferredoxin  100 
 
 		 122 aa  250  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.809791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1751  putative 2Fe-2S ferredoxin protein  91.8 
 
 		 122 aa  238  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0397  ferredoxin  91.8 
 
 		 122 aa  238  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.449026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  61.86 
 
 		 301 aa  157  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  61.02 
 
 		 301 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  61.02 
 
 		 302 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  60.17 
 
 		 302 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0232  ferredoxin, 2Fe-2S  60.66 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1188  ferredoxin  61.98 
 
 		 124 aa  147  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000641343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3149  ferredoxin  56.67 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3778  ferredoxin  55.74 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39700  Ferredoxin  54.92 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2342  ferredoxin  52.17 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1237  ferredoxin  58.26 
 
 		 114 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0193309 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1519  ferredoxin  58.26 
 
 		 114 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0937354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0287  ferredoxin  54.1 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1916  ferredoxin  50 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1449  ferredoxin  50 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0545  ferredoxin  43.97 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1236  ferredoxin  28.45 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0203128 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1518  ferredoxin, putative  28.45 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0846747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.18 
 
 		 316 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.21 
 
 		 316 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  33.33 
 
 		 316 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2391  ferredoxin  27.73 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4257  ferredoxin  28.57 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  33.33 
 
 		 319 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>