52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0287 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0287  ferredoxin  100 
 
 		 121 aa  247  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3778  ferredoxin  71.31 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  55.17 
 
 		 302 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  55.17 
 
 		 301 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  53.45 
 
 		 302 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  53.45 
 
 		 301 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2499  ferredoxin  54.1 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.809791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1751  putative 2Fe-2S ferredoxin protein  54.1 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0397  ferredoxin  54.1 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.449026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1188  ferredoxin  50.86 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000641343 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1519  ferredoxin  53.98 
 
 		 114 aa  119  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0937354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1237  ferredoxin  53.98 
 
 		 114 aa  119  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0193309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2342  ferredoxin  47.83 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0232  ferredoxin, 2Fe-2S  45 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1916  ferredoxin  45 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3149  ferredoxin  44.17 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39700  Ferredoxin  40.98 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1449  ferredoxin  46.15 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0545  ferredoxin  42.74 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2827  putative ferredoxin--NAD(+) reductase  44.9 
 
 		 419 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1236  ferredoxin  33.75 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0203128 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1518  ferredoxin, putative  33.75 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0846747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18640  flavodoxin reductase family protein  39.76 
 
 		 355 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  33.71 
 
 		 330 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1311  oxidoreductase FAD-binding region  29.91 
 
 		 340 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.577978  normal  0.18536 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  47.92 
 
 		 344 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4862  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.97 
 
 		 354 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350242  normal  0.072998 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0819  toluene monooxygenase oxidoreductase  40.35 
 
 		 339 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.18 
 
 		 684 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.69 
 
 		 343 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  47.37 
 
 		 346 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.69 
 
 		 343 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.69 
 
 		 343 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.69 
 
 		 343 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2391  ferredoxin  28.57 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.69 
 
 		 343 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.69 
 
 		 343 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.69 
 
 		 343 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.69 
 
 		 343 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.04 
 
 		 341 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4257  ferredoxin  28.57 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.94 
 
 		 343 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.94 
 
 		 343 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.94 
 
 		 343 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.94 
 
 		 343 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  28.57 
 
 		 339 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.94 
 
 		 343 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  28.57 
 
 		 339 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.94 
 
 		 343 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  28.57 
 
 		 339 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.94 
 
 		 343 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1231  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.67 
 
 		 364 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>