22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1519 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1237  ferredoxin  100 
 
 		 114 aa  238  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0193309 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1519  ferredoxin  100 
 
 		 114 aa  238  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0937354  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2342  ferredoxin  68.7 
 
 		 115 aa  176  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0232  ferredoxin, 2Fe-2S  62.61 
 
 		 122 aa  153  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  61.74 
 
 		 301 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  60.87 
 
 		 301 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  60 
 
 		 302 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  58.26 
 
 		 302 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3149  ferredoxin  55.65 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1188  ferredoxin  56.03 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000641343 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2499  ferredoxin  58.26 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.809791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1916  ferredoxin  53.04 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3778  ferredoxin  55.65 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1751  putative 2Fe-2S ferredoxin protein  53.98 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0397  ferredoxin  53.98 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.449026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0287  ferredoxin  53.98 
 
 		 121 aa  119  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39700  Ferredoxin  46.09 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1449  ferredoxin  48.28 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0545  ferredoxin  42.61 
 
 		 118 aa  92.8  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1236  ferredoxin  31.19 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0203128 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1518  ferredoxin, putative  31.19 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0846747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1091  ferredoxin oxidoreductase protein  42.59 
 
 		 328 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>