40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1188 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1188  ferredoxin  100 
 
 		 124 aa  254  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000641343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  65.55 
 
 		 302 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  64.71 
 
 		 302 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  64.71 
 
 		 301 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  63.03 
 
 		 301 aa  156  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0232  ferredoxin, 2Fe-2S  63.93 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2499  ferredoxin  61.98 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.809791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1751  putative 2Fe-2S ferredoxin protein  61.16 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0397  ferredoxin  61.16 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.449026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3149  ferredoxin  56.45 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39700  Ferredoxin  57.02 
 
 		 122 aa  140  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3778  ferredoxin  55.46 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1519  ferredoxin  56.03 
 
 		 114 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0937354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1237  ferredoxin  56.03 
 
 		 114 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0193309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1916  ferredoxin  53.28 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2342  ferredoxin  52.59 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0287  ferredoxin  50.86 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0545  ferredoxin  45.3 
 
 		 118 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1449  ferredoxin  48.31 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1236  ferredoxin  30.77 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0203128 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1518  ferredoxin, putative  30.77 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0846747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32140  anthranilate dioxygenase reductase  29.7 
 
 		 340 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  37.07 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2723  anthranilate dioxygenase reductase  29.7 
 
 		 340 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.24 
 
 		 336 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  33.33 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  53.33 
 
 		 361 aa  42  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4347  ferredoxin  30.7 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  28.89 
 
 		 330 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.92 
 
 		 346 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  36.76 
 
 		 319 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.71 
 
 		 336 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.831402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1368  ferredoxin  31.58 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  30.77 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2708  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.71 
 
 		 337 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.58 
 
 		 336 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.18 
 
 		 360 aa  40.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.9 
 
 		 339 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  40 
 
 		 616 aa  40  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  36.07 
 
 		 769 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>