More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0188 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0188  transposase, IS605 OrfB  100 
 
 
276 aa  555  1e-157  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000147679  normal  0.0541338 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0990  transposase IS605 OrfB  47.7 
 
 
282 aa  270  2e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.895253  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4205  transposase, IS605 OrfB family  31.11 
 
 
417 aa  68.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0534  transposase, IS605 OrfB family  30.11 
 
 
409 aa  68.9  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.268314  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0996  transposase, IS605 OrfB family  30.56 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3051  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
432 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2016  transposase  28.12 
 
 
372 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2314  transposase, IS605 OrfB family  29.57 
 
 
419 aa  62  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  27.84 
 
 
405 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3912  transposase, IS605 OrfB family  28.71 
 
 
422 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.108005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0800  transposase  26.56 
 
 
373 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2454  transposase, IS605 OrfB family  23.76 
 
 
395 aa  59.7  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.1066  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1189  transposase, IS605 OrfB family  31 
 
 
382 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2902  transposase  27.78 
 
 
407 aa  59.7  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00617488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1199  transposase IS605  27.18 
 
 
410 aa  58.9  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0968514  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2561  transposase, IS605 OrfB family  25.97 
 
 
440 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467488  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2491  transposase, IS605 OrfB family  24.56 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2549  transposase, IS605 OrfB family  24.68 
 
 
370 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735833  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  26.03 
 
 
435 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3391  transposase, IS605 OrfB family  24.75 
 
 
415 aa  57  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2633  transposase, IS605 OrfB family  24.7 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.56671  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2849  transposase, IS605 OrfB family  23.86 
 
 
402 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3330  Transport-associated OB domain protein  31.55 
 
 
418 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133521  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2346  transposase, IS605 OrfB family  25 
 
 
401 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0628  transposase, IS605 OrfB family  39.71 
 
 
411 aa  57  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2571  transposase, IS605 OrfB family  35.14 
 
 
413 aa  56.6  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  26.87 
 
 
370 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0386  IS605 family transposase OrfB  26.27 
 
 
394 aa  56.6  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2840  transposase, IS605 OrfB family  31.97 
 
 
413 aa  56.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249005  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  28.81 
 
 
403 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  28.81 
 
 
403 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  28.81 
 
 
403 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  28.81 
 
 
403 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3626  transposase, IS605 OrfB family  30.11 
 
 
425 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  25.35 
 
 
395 aa  55.8  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  28.81 
 
 
403 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  30.2 
 
 
394 aa  55.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  29.11 
 
 
402 aa  55.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  38.66 
 
 
380 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0681  transposase, IS605 OrfB family  34.34 
 
 
427 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146428  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  29.11 
 
 
402 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  29.11 
 
 
402 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3927  transposase, IS605 OrfB family  32.17 
 
 
409 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.770218  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2488  transposase, IS605 OrfB family  34.34 
 
 
439 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143837 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0597  transposase, IS605 OrfB family  25.2 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000997644  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2156  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
393 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2438  transposase, IS605 OrfB family  39.06 
 
 
391 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  25.45 
 
 
370 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  45.1 
 
 
405 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0485  transposase IS605 OrfB  22.22 
 
 
530 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0995557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  36.28 
 
 
384 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3375  transposase, IS605 OrfB family  22.83 
 
 
412 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  28.46 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  28.51 
 
 
450 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2779  transposase, IS605 OrfB family  28.8 
 
 
412 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306797  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1817  transposase IS605 OrfB  21.51 
 
 
530 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  28.51 
 
 
392 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  26.55 
 
 
381 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0216  hypothetical protein  34.85 
 
 
134 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  28.37 
 
 
406 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3397  transposase, IS605 OrfB family  34.21 
 
 
407 aa  52.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  27.27 
 
 
392 aa  52.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  28.03 
 
 
393 aa  52.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0877  IS605 family transposase OrfB  25.27 
 
 
372 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000122455  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  35.4 
 
 
384 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1123  transposase, IS605 OrfB family  26.88 
 
 
395 aa  52.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.144055  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  28.81 
 
 
370 aa  52.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2044  transposase, IS605 OrfB family  26.67 
 
 
418 aa  52  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0506  ISCpe2, transposase orfB  36.04 
 
 
129 aa  52.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0601  transposase, IS605 OrfB family  24.3 
 
 
399 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000137299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0132  transposase IS605 OrfB  21.91 
 
 
530 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.178018  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0819  transposase IS605 OrfB  21.83 
 
 
530 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.330178  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3030  transposase, IS605 OrfB family  43.4 
 
 
396 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2840  transposase, IS605 OrfB family  24.3 
 
 
351 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0123  transposase IS605 OrfB  21.91 
 
 
530 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0563  transposase, IS605 OrfB family  23.83 
 
 
375 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.11437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  29.17 
 
 
392 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2202  transposase, IS605 OrfB family  31.71 
 
 
417 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1480  IS605 family transposase OrfB  32.74 
 
 
362 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0523  transposase IS605 OrfB  22.44 
 
 
497 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.370544  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0928  transposase, IS605 OrfB  26.05 
 
 
450 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.621318  normal  0.596351 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3539  transposase, IS605 OrfB family  23.83 
 
 
375 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.3879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0121  IS605 family transposase OrfB  26.92 
 
 
395 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3343  transposase, IS605 OrfB family  24.9 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0389  transposase IS605 OrfB  22.22 
 
 
530 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.408689  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  35.4 
 
 
384 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  35.4 
 
 
384 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  35.4 
 
 
384 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  35.4 
 
 
384 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  35.4 
 
 
383 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  35.4 
 
 
384 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  35.4 
 
 
384 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  28.45 
 
 
405 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  24.03 
 
 
397 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  24.03 
 
 
397 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  28.81 
 
 
311 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  27.98 
 
 
381 aa  50.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0712  transposase, IS605 OrfB family  27.51 
 
 
506 aa  50.4  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0526534  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  25.96 
 
 
372 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0472  ISCpe2, transposase orfB  34.51 
 
 
384 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>