More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1385 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1385  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000012054  normal  0.0978836 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1253  ribosomal protein L20  81.74 
 
 		 116 aa  193  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78638  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0574  50S ribosomal protein L20  61.74 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 117 aa  130  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  127  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  53.04 
 
 		 117 aa  126  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  57.39 
 
 		 117 aa  125  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  55.26 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 117 aa  125  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0242  50S ribosomal protein L20  65 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  51.3 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0430  ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0129  50S ribosomal protein L20P  51.3 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.049531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  55.96 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  51.75 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  52.17 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 118 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 118 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0207  50S ribosomal protein L20  64.21 
 
 		 118 aa  121  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 118 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 118 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  50 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  120  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 120 aa  119  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  55.05 
 
 		 119 aa  120  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1034  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0469  50S ribosomal protein L20  51.3 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.667366  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1163  ribosomal protein L20  54.05 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000242027  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0536  ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00112168  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0113  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1010  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0761247  hitchhiker  0.00845124 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 125 aa  116  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05740  LSU ribosomal protein L20P  54.87 
 
 		 117 aa  116  9e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000012199  normal  0.0122872 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 118 aa  115  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  51.3 
 
 		 119 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0451  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  51.3 
 
 		 119 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1757  50S ribosomal protein L20  57.55 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0134124  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  51.3 
 
 		 119 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>