33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1651 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1867  hypothetical protein  95.74 
 
 
188 aa  329  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1588  hypothetical protein  95.65 
 
 
184 aa  322  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0287437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  76.16 
 
 
181 aa  266  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  65.05 
 
 
178 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  67.46 
 
 
178 aa  228  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0224  hypothetical protein  46.15 
 
 
179 aa  150  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335655  normal  0.0429524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0337  hypothetical protein  37.42 
 
 
179 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1447  hypothetical protein  36.14 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0105  hypothetical protein  32.39 
 
 
178 aa  72  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0386  hypothetical protein  34.62 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.256767  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4382  hypothetical protein  32.26 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  31.21 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1806  hypothetical protein  34.09 
 
 
193 aa  61.6  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1739  putative lipoprotein  34.09 
 
 
193 aa  61.6  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0285  hypothetical protein  28.49 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0099  hypothetical protein  32.76 
 
 
194 aa  61.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.485401  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0291  hypothetical protein  31.41 
 
 
187 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0935679  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1096  hypothetical protein  32.26 
 
 
193 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0435  hypothetical protein  30.77 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3210  hypothetical protein  31.82 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3199  hypothetical protein  34.07 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0092  hypothetical protein  28.42 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.101272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0044  putative lipoprotein  29.09 
 
 
177 aa  54.7  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2497  secreted periplasmic protein  30.86 
 
 
162 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3925  hypothetical protein  28.74 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0839  secreted periplasmic protein  30.86 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4251  hypothetical protein  27.17 
 
 
173 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3136  hypothetical protein  28.29 
 
 
162 aa  51.2  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00952291  hitchhiker  0.00000280076 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3630  twin-arginine translocation pathway signal  30.73 
 
 
187 aa  48.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1279  hypothetical protein  27.98 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2766  secreted periplasmic protein  27.78 
 
 
161 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0410  putative lipoprotein  31.97 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.936059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>