21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3136 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3136  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00952291  hitchhiker  0.00000280076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0839  secreted periplasmic protein  88.89 
 
 		 162 aa  295  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2497  secreted periplasmic protein  88.27 
 
 		 162 aa  295  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2766  secreted periplasmic protein  49.33 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0056  hypothetical protein  42.77 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000644124 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0044  putative lipoprotein  42.77 
 
 		 177 aa  120  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0410  putative lipoprotein  41.55 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.936059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2958  hypothetical protein  31.21 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3019  hypothetical protein  31.13 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2851  secreted (periplasmic)-like protein  31.29 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110924  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  32.56 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  31.98 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5029  hypothetical protein  27.01 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3630  twin-arginine translocation pathway signal  32.56 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  30.67 
 
 		 181 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  28.19 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0337  hypothetical protein  30.67 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3216  hypothetical protein  28.24 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1588  hypothetical protein  29.05 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1867  hypothetical protein  29.05 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3133  hypothetical protein  26.28 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>