32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1405 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  349  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  89.33 
 
 		 178 aa  314  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  69.68 
 
 		 188 aa  220  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  63.43 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1867  hypothetical protein  68.83 
 
 		 188 aa  216  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1588  hypothetical protein  68.83 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287437 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0224  hypothetical protein  47.62 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335655  normal  0.0429524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0337  hypothetical protein  40.52 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  35.03 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1447  hypothetical protein  33.94 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0291  hypothetical protein  32.05 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0935679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0386  hypothetical protein  31.41 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.256767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3210  hypothetical protein  33.99 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0435  hypothetical protein  30.13 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0099  hypothetical protein  29.94 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.485401  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1739  putative lipoprotein  33.9 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1806  hypothetical protein  33.9 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4382  hypothetical protein  34.29 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0092  hypothetical protein  30.19 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0285  hypothetical protein  30.38 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0105  hypothetical protein  34.93 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1096  hypothetical protein  33.14 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2766  secreted periplasmic protein  32.08 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3199  hypothetical protein  30.81 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3136  hypothetical protein  31.06 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00952291  hitchhiker  0.00000280076 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2497  secreted periplasmic protein  32.28 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0839  secreted periplasmic protein  32.28 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0044  putative lipoprotein  30.92 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0410  putative lipoprotein  32.65 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.936059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3925  hypothetical protein  29.41 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3630  twin-arginine translocation pathway signal  29.79 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2958  hypothetical protein  29.94 
 
 		 167 aa  41.6  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>