20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2766 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2766  secreted periplasmic protein  100 
 
 		 161 aa  324  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2497  secreted periplasmic protein  47.33 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0839  secreted periplasmic protein  47.33 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3136  hypothetical protein  49.33 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00952291  hitchhiker  0.00000280076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0410  putative lipoprotein  45.26 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.936059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0044  putative lipoprotein  43.54 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0056  hypothetical protein  42.36 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000644124 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2958  hypothetical protein  30.91 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  31.14 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  31.95 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3019  hypothetical protein  30.34 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5029  hypothetical protein  28.78 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0224  hypothetical protein  29.17 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335655  normal  0.0429524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  30.63 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1867  hypothetical protein  28.1 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  27.78 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2851  secreted (periplasmic)-like protein  29.5 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110924  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1588  hypothetical protein  28.1 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3630  twin-arginine translocation pathway signal  31.4 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3216  hypothetical protein  26.67 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>