24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5029 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_5029  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  337  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2958  hypothetical protein  34.39 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2851  secreted (periplasmic)-like protein  32.43 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110924  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0839  secreted periplasmic protein  29.41 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2497  secreted periplasmic protein  29.41 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1279  hypothetical protein  32.3 
 
 
178 aa  62  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2766  secreted periplasmic protein  29.08 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3136  hypothetical protein  27.89 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00952291  hitchhiker  0.00000280076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  33.92 
 
 
178 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0337  hypothetical protein  30.67 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0044  putative lipoprotein  26.04 
 
 
177 aa  50.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  26.88 
 
 
183 aa  51.2  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3019  hypothetical protein  27.7 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3216  hypothetical protein  30.16 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1447  hypothetical protein  30.38 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0291  hypothetical protein  31.87 
 
 
187 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0935679  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0410  putative lipoprotein  27.27 
 
 
160 aa  47.4  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.936059  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0435  hypothetical protein  29.22 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0092  hypothetical protein  26.16 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.101272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3199  hypothetical protein  29.41 
 
 
181 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0386  hypothetical protein  38.46 
 
 
186 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.256767  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0285  hypothetical protein  28.82 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  31.71 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  30.36 
 
 
178 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.199506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>