31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0170 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0099  hypothetical protein  70.06 
 
 		 194 aa  261  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.485401  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0285  hypothetical protein  65.93 
 
 		 183 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0092  hypothetical protein  68.36 
 
 		 194 aa  256  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0386  hypothetical protein  65.41 
 
 		 186 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.256767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0435  hypothetical protein  64.78 
 
 		 186 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0291  hypothetical protein  60.38 
 
 		 187 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0935679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1447  hypothetical protein  35.88 
 
 		 205 aa  90.9  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  35.33 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0337  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335655  normal  0.0429524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  33.71 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  32.75 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1867  hypothetical protein  33.54 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1588  hypothetical protein  33.54 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3210  hypothetical protein  33.54 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  31.21 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3925  hypothetical protein  27.54 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4382  hypothetical protein  30.98 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1739  putative lipoprotein  32.93 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3199  hypothetical protein  29.81 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1806  hypothetical protein  32.93 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4251  hypothetical protein  25.15 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1096  hypothetical protein  33.69 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3630  twin-arginine translocation pathway signal  35.2 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0105  hypothetical protein  32.24 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1279  hypothetical protein  26.4 
 
 		 178 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2851  secreted (periplasmic)-like protein  27.56 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110924  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3019  hypothetical protein  28.4 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5029  hypothetical protein  25.33 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2958  hypothetical protein  27.43 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>