16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0044 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0044  putative lipoprotein  100 
 
 		 177 aa  352  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2497  secreted periplasmic protein  43.68 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0839  secreted periplasmic protein  43.1 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3136  hypothetical protein  43.15 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00952291  hitchhiker  0.00000280076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2766  secreted periplasmic protein  43.36 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0056  hypothetical protein  43.36 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000644124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0410  putative lipoprotein  34.97 
 
 		 160 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.936059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2958  hypothetical protein  28.83 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2851  secreted (periplasmic)-like protein  30.56 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110924  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3019  hypothetical protein  30.43 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  28.31 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  31.33 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  30.92 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  28.08 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3216  hypothetical protein  34.26 
 
 		 143 aa  45.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5029  hypothetical protein  25.18 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.680332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>