30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0337 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0337  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0224  hypothetical protein  57.54 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335655  normal  0.0429524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  40.24 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  34.83 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1588  hypothetical protein  38.46 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1867  hypothetical protein  38.46 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  37.42 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0291  hypothetical protein  33.97 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0935679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3210  hypothetical protein  35.14 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  33.76 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0092  hypothetical protein  31.33 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0386  hypothetical protein  32.69 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.256767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0435  hypothetical protein  32.69 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1447  hypothetical protein  31.29 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0099  hypothetical protein  30.81 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.485401  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1739  putative lipoprotein  35.67 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1806  hypothetical protein  35.67 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0285  hypothetical protein  30.36 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1096  hypothetical protein  33.92 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3199  hypothetical protein  32.34 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0105  hypothetical protein  32.37 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4382  hypothetical protein  32.7 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3925  hypothetical protein  30.12 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4251  hypothetical protein  29.52 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2851  secreted (periplasmic)-like protein  28.49 
 
 		 168 aa  50.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110924  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3136  hypothetical protein  30.67 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00952291  hitchhiker  0.00000280076 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2497  secreted periplasmic protein  31.45 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0839  secreted periplasmic protein  31.45 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5029  hypothetical protein  27.66 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.680332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>