22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2851 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2851  secreted (periplasmic)-like protein  100 
 
 		 168 aa  328  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110924  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3019  hypothetical protein  64.52 
 
 		 182 aa  190  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3216  hypothetical protein  52.94 
 
 		 143 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5029  hypothetical protein  31.85 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0839  secreted periplasmic protein  33.99 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2497  secreted periplasmic protein  33.99 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3136  hypothetical protein  31.29 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00952291  hitchhiker  0.00000280076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1279  hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3199  hypothetical protein  29.82 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0044  putative lipoprotein  30.87 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0099  hypothetical protein  29.48 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.485401  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0092  hypothetical protein  28.74 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0386  hypothetical protein  30.38 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.256767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0337  hypothetical protein  30.11 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0285  hypothetical protein  30.46 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2049  secreted (periplasmic) protein-like protein  27.78 
 
 		 172 aa  47.4  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131308  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2766  secreted periplasmic protein  29.5 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0435  hypothetical protein  27.22 
 
 		 186 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  27.56 
 
 		 183 aa  44.3  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0224  hypothetical protein  30.38 
 
 		 179 aa  44.3  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335655  normal  0.0429524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3210  hypothetical protein  28.37 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0291  hypothetical protein  27.78 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0935679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>