11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3216 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3216  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  277  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3019  hypothetical protein  58.99 
 
 		 182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2851  secreted (periplasmic)-like protein  52.94 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110924  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5029  hypothetical protein  30.16 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3136  hypothetical protein  28.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00952291  hitchhiker  0.00000280076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0044  putative lipoprotein  34.26 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2958  hypothetical protein  31.03 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3630  twin-arginine translocation pathway signal  30.58 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2766  secreted periplasmic protein  26.67 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1279  hypothetical protein  27.59 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0099  hypothetical protein  29.73 
 
 		 194 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.485401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>