30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0224 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0224  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  363  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335655  normal  0.0429524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0337  hypothetical protein  61.33 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  47.62 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  46.24 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  48.08 
 
 		 178 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1867  hypothetical protein  48.7 
 
 		 188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1588  hypothetical protein  48.7 
 
 		 184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  48.05 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1739  putative lipoprotein  39.55 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1806  hypothetical protein  39.55 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0291  hypothetical protein  32.28 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0935679  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1096  hypothetical protein  36.21 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1447  hypothetical protein  35.9 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0285  hypothetical protein  31.68 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3210  hypothetical protein  31.76 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0092  hypothetical protein  32.63 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  32.72 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0099  hypothetical protein  31.18 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.485401  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0105  hypothetical protein  35.63 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0386  hypothetical protein  30.38 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.256767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0435  hypothetical protein  29.75 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4382  hypothetical protein  35.88 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3199  hypothetical protein  34.52 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3925  hypothetical protein  29.41 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4251  hypothetical protein  30.59 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2766  secreted periplasmic protein  27.81 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2851  secreted (periplasmic)-like protein  28.97 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110924  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0839  secreted periplasmic protein  30.46 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2497  secreted periplasmic protein  30.46 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0410  putative lipoprotein  32.39 
 
 		 160 aa  41.2  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.936059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>