27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3210 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3210  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  354  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1096  hypothetical protein  43.78 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1806  hypothetical protein  38.59 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1739  putative lipoprotein  38.59 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3199  hypothetical protein  36.42 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0105  hypothetical protein  34.08 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0337  hypothetical protein  35.14 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131786 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4382  hypothetical protein  37.72 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0291  hypothetical protein  37.34 
 
 
187 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0935679  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0435  hypothetical protein  36.08 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3925  hypothetical protein  33.99 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0224  hypothetical protein  31.58 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335655  normal  0.0429524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  33.92 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  34.5 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0386  hypothetical protein  35.1 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.256767  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  32.92 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4251  hypothetical protein  32.68 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  34.53 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0285  hypothetical protein  32.42 
 
 
183 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  32.86 
 
 
188 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0099  hypothetical protein  30.86 
 
 
194 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.485401  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1588  hypothetical protein  33.57 
 
 
184 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0287437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1867  hypothetical protein  33.57 
 
 
188 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0092  hypothetical protein  29.94 
 
 
194 aa  57  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.101272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1447  hypothetical protein  28.22 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2851  secreted (periplasmic)-like protein  28.37 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110924  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1279  hypothetical protein  28.93 
 
 
178 aa  41.2  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>