184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2426 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2426  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3769  redoxin domain-containing protein  51.91 
 
 
167 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3452  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.52 
 
 
165 aa  94.4  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3254  hypothetical protein  35.16 
 
 
172 aa  92  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3250  hypothetical protein  32.67 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3124  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.54 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3418  thioredoxin-like protein  33.08 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308929  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4714  thioredoxin-like  34.96 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000807969  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  31.45 
 
 
170 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  29.56 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  27.01 
 
 
179 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.65 
 
 
409 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  23.53 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  25.49 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.4 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  25.95 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  30.3 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  26.95 
 
 
174 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0817  Redoxin domain protein  25.6 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0724066  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.89 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  22.4 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  27.73 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  26.72 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.82 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.65 
 
 
175 aa  52  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  25.53 
 
 
170 aa  52  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3204  thioredoxin family protein, putative  28.06 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.04 
 
 
174 aa  51.6  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.53 
 
 
193 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  19.11 
 
 
173 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  29.31 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  26.72 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  24.6 
 
 
172 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  30 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.01 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  29.31 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.24 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  19.11 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  25.86 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  20.78 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  28.38 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  25.93 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  29.73 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  25.49 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.45 
 
 
174 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  24.52 
 
 
176 aa  48.9  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  25.52 
 
 
174 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1928  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  20.9 
 
 
183 aa  48.5  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.652807  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  26.36 
 
 
184 aa  48.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  26.55 
 
 
422 aa  48.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1441  Redoxin domain protein  27.55 
 
 
158 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.21 
 
 
189 aa  48.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  23.03 
 
 
174 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  27.41 
 
 
184 aa  47.8  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1263  Redoxin domain protein  26.83 
 
 
195 aa  47.8  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447242  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  30.53 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  28.77 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  24.58 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2523  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 
369 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.434668  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  19.11 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  18.47 
 
 
173 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  25.96 
 
 
195 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  19.11 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  26.09 
 
 
178 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  26.09 
 
 
178 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  19.11 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.8 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_556  thiol-disulfide oxidoreductase  18.81 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  25.86 
 
 
203 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  25.86 
 
 
203 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  25.86 
 
 
203 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  26.09 
 
 
178 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  26.05 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  26.09 
 
 
178 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  26.09 
 
 
178 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  26.09 
 
 
178 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  26.09 
 
 
178 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  19.75 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  24.51 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  19.11 
 
 
173 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.39 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  23.44 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  25 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  23.45 
 
 
403 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  31.52 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  21.37 
 
 
211 aa  45.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.4 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.73 
 
 
173 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  23.81 
 
 
403 aa  45.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  19.11 
 
 
173 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  30.77 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0591  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.54 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0918415  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  19.23 
 
 
164 aa  45.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0183  Redoxin domain protein  18.58 
 
 
154 aa  45.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3091  Redoxin domain protein  25.41 
 
 
203 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  24.37 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.45 
 
 
166 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.57 
 
 
189 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  27.05 
 
 
167 aa  45.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  23.73 
 
 
211 aa  45.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>