More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4714 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4714  thioredoxin-like  100 
 
 
162 aa  322  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000807969  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3250  hypothetical protein  42.03 
 
 
165 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3418  thioredoxin-like protein  44.93 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308929  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3254  hypothetical protein  38.41 
 
 
172 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3452  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.29 
 
 
165 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3124  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.57 
 
 
170 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2426  hypothetical protein  34 
 
 
182 aa  87.4  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3769  redoxin domain-containing protein  31.62 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.56 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6267  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.71 
 
 
658 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1400  Redoxin domain protein  34.71 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  28.47 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  31.53 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  31.03 
 
 
188 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  30.37 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  27.54 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  29.21 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  27.54 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.01 
 
 
189 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  27.54 
 
 
173 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  27.54 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0948  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.15 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  33.33 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  31.86 
 
 
195 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  27.87 
 
 
174 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.59 
 
 
206 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  25.56 
 
 
173 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  25.56 
 
 
173 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  27.94 
 
 
173 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.85 
 
 
228 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  32.14 
 
 
189 aa  62  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.68 
 
 
184 aa  61.6  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  30.15 
 
 
174 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  31.62 
 
 
200 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3091  Redoxin domain protein  29.91 
 
 
203 aa  61.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.06 
 
 
182 aa  60.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  25.56 
 
 
173 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  29.66 
 
 
184 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.66 
 
 
196 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  26.75 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  27.01 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  28.06 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1411  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.32 
 
 
180 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  24.81 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1155  redoxin  28.97 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  28.7 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  31.2 
 
 
190 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  35 
 
 
447 aa  58.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  33.33 
 
 
191 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  33.33 
 
 
191 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  33.33 
 
 
191 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  33.33 
 
 
191 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  33.33 
 
 
191 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  32.26 
 
 
191 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.68 
 
 
178 aa  58.2  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31 
 
 
201 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.86 
 
 
200 aa  58.2  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.55 
 
 
409 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.66 
 
 
184 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0940  periplasmic protein thiol/disulfide oxidoreductase DsbE  34.31 
 
 
185 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  24.81 
 
 
173 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  38.24 
 
 
168 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  29.41 
 
 
433 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2287  putative thiol:disulfide interchange protein  36.67 
 
 
152 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129752  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.07 
 
 
191 aa  57.4  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.54 
 
 
203 aa  57.4  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  27.03 
 
 
176 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  28.77 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  32.26 
 
 
191 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  32.43 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  28.21 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  39.71 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.08 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  28.21 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0679  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.33 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  39.71 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  25.6 
 
 
179 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2528  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.89 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  27.07 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  28.74 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.96 
 
 
179 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  26.83 
 
 
180 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03915  putative thiol:disulfide interchange protein  36.67 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  28.21 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  28.21 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  28.21 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  27.04 
 
 
195 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  32.54 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.1 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  28.21 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  32.97 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  26.99 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  29.41 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  28.21 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  26.17 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.04 
 
 
195 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.41 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  27.94 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>